Има много институции за висше образование през целия Киргизстан. Това включва около тридесет и седем държавни университети и осемнадесет частни университети. Видни университети в Киргизстан включват Университета на Централна Азия и Киргизката National University.

Магистратурите MA са за студенти, които искат да придобият степен „магистър по изкуства“ след успешно изучаване на хуманитарни дисциплини като история, комуникации, философия теология или английски език, или изящни изкуства. Такива магистърски програми обикновено подразбират изучаване на теоретични и практически дисциплини и държане на изпити.